ارسال پیشنهاد

0

تعداد پیشنهاد ها

اشتراک گذاری

گزارش تخلف

گزارش مالی

پایتون یا R+(50943)

ورودی: فایل fasta حاوی contigهای اسمبلی شده با حداقل طول 200bp (حدود 5 میلیون contigs) خروجی: نوع آنزیم کد شده توسط هر کانتیک به همراه توالی آن به فرمت fasta ۱)در ابتدا فایل حاوی کانتیگ ها به ۶ فریم ترجمه شود. (بصورت دستی و با کد پایتون یا R انجام شود چون کدها هم برای ارائه لازم است) ۲) سپس ۶فریم بدست امده(توالی پروتئینی) با دیتابیس non-redundant protein NCBI بصورت اتوماتیک(بااستفاده از API به سرور NCBI( هم ردیف شوند. براساس بالاترین score bit و بیشترین coverage ،صحیح ترین توالی پروتئینی بین ۶ فریم ترجمه شده، انتخاب شود. (برای تعیین پروتین اصلی حتما باید یه کد پایتون یا R نوشته شود ) خروجی باید فایل fasta باشد که در توضیح هر توالی منتخب، نام کانتیگ و آنزیم مربوطه ذکر شود با پایتون یا R زمان کمی دارم دو روز

Niko
Niko

امتیاز : 0/5

پایتون (python)
برنامه نویسی با R
فایل ضمیمه
zip

FASTA.contigs.zip

2 کیلوبایت

تایم لاین پروژه

درخواست پشتیبانی
  • در انتظار پرداخت

    پرداخت تعرفه ثبت پروژه های غیر رایگان

  • در حال بررسی

    برسی و تایید پروژه از طرف مدیرت سایت

  • آماده دریافت پیشنهادها

    تایید پروژه و نمایش برای مجریان

  • در انتظار پرداخت هزینه پروژه

    پرداخت هزینه اجرای پروژه توسط کارفرما

  • در انتظار پرداخت ضمانت اجرا

    پرداخت مبلغ ضمانت اجرا توسط مجری

  • در حال انجام

    پروژه شما درحال انجام می باشد

  • انجام شد

    اتمام اجرای پروژه

لیست پیشنهادها

هیچ پیشنهادی ارسال نشده است

  • اطلاعات پروژه
  • 3954کد پروژه
  • کمک آموزشی

    دسته بندی
  • 26 بهمن 1401تاریخ ثبت
  • 2 روزمهلت اجرا
  • 100,000 تومانحداقل بودجه
  • 300,000 تومانحداکثر بودجه
  • 5 درصد ضمانت اجرا
  • آماده دریافت پیشنهادها وضعیت